
Die 3DS-Version von Mario & Sonic at the London 2012 Olympic Games weist einige wesentliche Unterschiede zur Wii-Version auf. Während sie viele Events teilt, bietet sie mehr davon. Sie enthält außerdem einen exklusiven Story-Modus. Die Protagonisten der Mario- und Sonic-Reihe verbünden sich, um Bowser und Dr. Eggman zu besiegen, die zusammen mit ihren Untergebenen London übernommen haben. Die Geschichte ist in verschiedene Teile unterteilt, abhängig davon, welcher Charakter gespielt wird. Der Spieler muss gegen die Antagonisten in Wettbewerben gewinnen. Die spielbaren Charaktere bestehen aus allen 20 spielbaren Charakteren der Nintendo DS-Version des vorherigen Spiels und sind in fünf Gruppen zu je vier Charakteren aufgeteilt.
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