

Medarot 3 a été lancé en 2000 pour la Game Boy Color. Il a été sorti en deux versions : Kabuto et Kuwagata. Le jeu suit Ikki Tenryou et ses amis dans la ville d'Omikuji. Après qu'Ikki ait combattu avec les Screws, les données de tous les Medarotch sont soudainement effacées par une figure inconnue. Medarot 3 a introduit divers nouveaux aspects du gameplay, notamment Medachange et Medalias.