

Covert Operations è un add-on per Command & Conquer che include 15 nuove missioni, nuove tracce musicali e mappe per la modalità multiplayer. A differenza del gioco originale, le missioni di Covert Operations possono essere giocate in qualsiasi momento e nell'ordine che si desidera, senza essere accompagnate da filmati introduttivi. Aggiunge due nuove unità al gioco, e le nuove missioni sono più difficili rispetto a quelle originali. L'add-on include la colonna sonora della versione DOS, che presenta musiche assenti nella versione Windows 95 (o Gold Edition). Inizialmente, Covert Operations era necessario per sbloccare le missioni segrete, che in seguito sono state attivate tramite un aggiornamento del gioco principale.
| PC | 1 gennaio 1996 |
| DOS | 1 gennaio 1996 |