
Gakuen K è un visual novel per otome basato su K Project di GoHands e GoRa, che vede come protagonista un personaggio originale esclusivo del gioco, Konohana Saya.
Konohana Saya era solo una studentessa liceale normale, ma improvvisamente i suoi poteri si risvegliano. Non riuscendo a controllarli, va in tilt. Isolata dai suoi compagni a causa delle sue capacità, decide che non ha altra scelta che lasciare la sua scuola. Riceve quindi una lettera di invito da parte di Miwa Ichigen, preside della "Super" Ashinaka Academy. Saya si trasferisce quindi nell'istituto come studentessa "eccezionale". Guidata per l'istituto dalla sua gentile compagna di classe, Yukizome Kukuri, l'eccitazione di Saya per la sua nuova vita scolastica viene interrotta quando si ritrova coinvolta in mezzo a una disputa tra due club. I club che stavano litigando tra loro erano due dei sette club speciali. Il Club Rosso, comunemente chiamato "HOMRA", e il Club Blu, comunemente indicato come "SCEPTER 4". Osservata da posti anche inaspettati dai leader di vari club, Saya viene salvata da tre membri appartenenti a uno dei sette club speciali: il Club Argento. I tre erano il leader del club Isana Yashiro, insieme a Yatogami Kurou e Neko. Circondata da molti personaggi individualisti, si alzano le tende per la nuova vita scolastica di Saya.