
La versione per Game Boy offre l'opzione di giocare impersonando Ramius o il comandante della nave da trasporto della Marina sovietica. Il gioco prevede otto stage, che iniziano in Groenlandia e terminano lungo la costa occidentale degli Stati Uniti. Il quinto stage mostra architetture greche, un uovo di Pasqua in cui è stata inavvertitamente scoperta la perduta città di Atlantide. Nella parte del comandante della nave da trasporto, la missione del giocatore è affondare il Red October, senza risparmiare mezzi.
Siamo nel 1984. Un sottomarino sovietico della classe Typhoon chiamato Red October è comandato dal capitano Marko Ramius, il quale deve guidare la nave verso gli Stati Uniti e impedire che venga utilizzata in modo errato per scatenare una guerra. Il giocatore guida il sottomarino omonimo attraverso una serie di fasi sottomarine, evitando collisioni con muri e superfici, mentre elimina minacce navali e aeree con siluri, testate missilistiche guidate e il Caterpillar Drive per la copertura temporanea di invisibilità. È presente un radar all'interno del gioco che mostra l'area circostante al sottomarino e qualsiasi unità presente nei dintorni.

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