
Pela primeira vez, heróis e vilões populares da Nickelodeon colaboram verdadeiramente, unindo-se e se cruzando em diversos ambientes de desenhos animados da Nickelodeon, interagindo entre si e trabalhando juntos para resolver quebra-cabeças nessa aventura ultimate da Nick. Personagens jogáveis vêm dos programas mais populares da Nickelodeon, incluindo SpongeBob SquarePants, The Fairly OddParents, a equipe Rocket Power, Jimmy Neutron e Tak. Nicktoons também marca o estreio em jogos de novas propriedades da Nickelodeon: Danny Phantom e Rugrats All Grown Up.
O jogo começa com SpongeBob descobrindo que Plankton está tomando conta de Bikini Bottom com máquinas aspiradoras gigantes. Goddard sai de um portal atrás da casa de SpongeBob e exibe uma mensagem para ele de Jimmy Neutron. Seguindo Goddard pelo portal, ele encontra Jimmy Neutron, Timmy Turner e Danny Phantom no laboratório de Jimmy. Jimmy cobre SpongeBob com uma umidade auto-regenerativa para que ele não desidrate. Jimmy explica que sua invenção mais recente, a Máquina do Portal Universal, foi copiada por Professor Calamitous, que formou uma Síndicate com Plankton, Vlad Plasmius e Denzel Crocker, e já estão roubando energia dos seus mundos. Os heróis tentam se teletransportar para a Escola Casper, mas chegam ao castelo de Vlad, onde ele revela que seu portal de fantasmas está sugando energia da Zona Fantasma, e capturou os pais de Danny. Vlad derruba o grupo e os imprime na Prisão da Zona Fantasma. Ao se tornarem amigos do Box Ghost, os heróis fogem após derrotar Walker. Danny leva os heróis ao portal fantasma da Fenton Works, e encontram Sam Manson e Tucker Foley. Ao retornar ao castelo, o grupo destrói os geradores do portal. Danny se apodera de seu pai e usa seus Guantes Fantasma para atacar Vlad, mas acaba escapando. Os heróis então viajam para Bikini Bottom, usando a goma de ar de Jimmy para respirar debaixo d'água. Sandy Cheeks os envia para os Campos de Medusas para encontrarem Patrick Star, mas é sugada por uma máquina de captura de medusas. Após destruirem as máquinas, o grupo se encontra no navio do Flying Dutchman. Danny convence-o a deixá-los ir em troca de trazer de volta seus antigos companheiros. Ao chegarem no Chum Bucket, eles libertam Patrick e as medusas. No telhado, eles lutam contra Plankton pilotando um caranguejo robótico gigante para resgatar o Sr. Krabs, e descobrem que os vilões têm estado extraídos energia para alimentar uma Máquina do Apocalipse. Em Dimmsdale, os heróis infiltram-se e desligam a energia da fortaleza dourada de Crocker. Eles então seguem para o Mundo das Fadas, onde encontram Jorgen von Strangle, libertam as fadas e derrotam Crocker pilotando um exoesqueleto no Big Wand. O grupo então retorna ao laboratório de Jimmy e encontra Cindy Vortex. Jimmy percebe então que Calamitous plantou um inseto espia em Goddard para espioná-lo. Os heróis usam o raio encolhedor de Jimmy para se encolherem e entrarem em Goddard, derrotam o inseto espia e o hackeiam para localizar a caverna de Calamitous. Os heróis derrotam a Síndicate, e SpongeBob desliga a Máquina do Apocalipse. Com Calamitous preso, Jimmy dá aos heróis cada um um Neutronic Recaller, caso haja futuros incidentes, e eles se despedem.
| PS2 | 26 de outubro de 2005 |
| NGC | 27 de outubro de 2005 |
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