
Diese Version ist eine feierliche Veröffentlichung von Taito anlässlich der 3000 aktiven Densha de Go! 2 Arcade-Units in ganz Japan, unter dem Titel Densha de Go! 2 Kousoku-hen 3000-bandai. Sie fügt elf neue Strecken und mehrere neue Zugmodelle hinzu. Upgrade-Kits und neue Kabinette wurden im August/September 1998 angeboten. Diese Version wurde 2000 auf Dreamcast und Windows PC portiert. Sie dient außerdem als Grundlage für das Jahr 1999 erschienene Densha de Go! 64.
| Arcade | 1. September 1998 |
| DC | 20. Januar 2000 |
| PC | 1. April 2000 |

