

Rex muss verhindern, dass Van Kleiss und seine Untergebenen ungeahnte Kräfte erlangen, die die Erde zerstören könnten. Multi-Head, Biowulf und das Herz von Aquania erscheinen im Spiel als unterstützende Bösewichte. Als Rex eine Mission startet, um den EVO, den mehrköpfigen EVO, zu besiegen, entdeckt er ein Stück einer Bauplanzeichnung, welches später von Breach gestohlen wird. Dies führt dazu, dass Rex einige seiner neuen Builds verliert. Er berichtet Providence über diesen Vorfall und geht in den Dschungel. Ein Teil der Bauplanzeichnung befindet sich im Labor von Dr. Rylander, wo Rex Rylanders Daten kopiert. Kurz darauf wird er vom „Rabbit EVO“ angegriffen, den er später besiegt. Breach stiehlt erneut den Bauplan, als Rex zurück nach Providence kehrt. Danach begibt sich Rex mit Bobo Haha nach Hong Kong, um Quarry (Rex ursprünglicher Boss) davon abzuhalten, Gegenstände zu stehlen, darunter auch ein Stück des Bauplans. Zu Rex' Überraschung trifft er dort seine romantische Liebe, Circe. Er stellt fest, dass sie erneut für Van Kleiss arbeitet, da er ihr vorher geholfen hat, aus dessen Gewalt zu entkommen.
| PS3 | 1. November 2011 |
| Wii | 1. November 2011 |
| NDS | 1. November 2011 |
| X360 | 1. November 2011 |
| 3DS | 1. November 2011 |