

Die Handheld-Versionen von LEGO Batman 2: DC Super Heroes (die Fortsetzung von LEGO Batman: The Videogame) behalten dieselbe Handlung wie ihre Konsolenzusammengehörigen, in der Batman und Robin sich mit Charakteren aus dem DC-Universum (darunter Superman, Green Lantern, The Flash und Wonder Woman) zusammenschließen müssen, um Gotham City vor der neu gebildeten Allianz aus The Joker und Lex Luthor zu retten. Diese Versionen enthalten 14 Level, in denen die Spieler Batman und Robin (später unterstützt von der Justice League) dabei helfen, Studs zu sammeln, Feinde zu besiegen und mit zahlreichen Objekten in einer offenen Spielwelt zu interagieren, die der der Konsolenversionen ähnelt. Nach Abschluss der Hauptgeschichte gibt es zusätzliche Missionen, die man mit der Justice League absolvieren kann, um 5 weitere Charaktere im Batcomputer freizuschalten. Minikit-Teile, die gesammelt werden, entsperren einen neuen Charakter (jeder Minikit entspricht einem Charakter), Rote Steine aktivieren Fähigkeiten im Extras-Menü und Sound Bites (eine in diesem Spiel eingeführte Funktion, bestehend aus blauen Musiknoten) enthalten kurze Sprechdialoge bestimmter Charaktere. Der Touchscreen der 3DS- und DS-Konsolen wird genutzt, um Charaktere auszuwählen, die aktuellen Fähigkeiten des Charakters zu bestimmen und jederzeit einen Charakter zum Spielen auszuwählen (nur in Free Play genutzt), während die eigentliche Aktion auf dem Oberbildschirm stattfindet. Im Gegensatz dazu erfolgt bei der PS Vita alles auf einem einzigen Bildschirm. Außerdem speichern die Handheld-Versionen den aktuellen Fortschritt jedes Levels und können jederzeit über das Load Game-Menü darauf zugreifen.
| 3DS | 19. Juni 2012 |
| NDS | 19. Juni 2012 |
| Vita | 19. Juni 2012 |
| iOS | 24. April 2013 |
| Android | 1. März 2016 |