

Persona 3 Em ist ein Rollenspiel für Mobiltelefone, das als Nebenhandlung während der Yakushima-Reise von Persona 3 spielt. Es emuliert das Originalspiel mit einer tagsüber stattfindenden, sozialen Interaktionsphase und einer nächtlichen Phase, in der man durch Gänge kriecht.
Während der Nacht, wenn die Mitglieder von S.E.E.S. schlafen gehen, erwachen sie in der „Nightmare Hour“, was der Dark Hour aus den Hauptspielen ähnelt. In dieser Zeit müssen sie ein Tartarus-ähnliches Dungeon namens Oneiros erkunden, dessen Eingang ein hohler Durchgang innerhalb eines großen Baumes ist. Während ihrer Erkundung von Oneiros begegnet die Gruppe regelmäßig Arche-Persona-Bossen in 20-Geschoß-Abständen. Die ersten beiden Bossen hängen davon ab, wer sich zum Zeitpunkt des Erreichens dieser Stockwerke im Party-Team befindet. Die Statistiken dieser ersten beiden Bossen sind fixiert und skalieren nicht. Unabhängig davon werden Fuka und der Protagonist jeweils auf dem 60. und 80. Stockwerk als Arche-Personas begegnet.