
Import Tuner Challenge se déroule sur les autoroutes Shuto de Tokyo, au Japon. Il y a un total de 415 adversaires dans le jeu. Comme de nombreux autres jeux de la série TXR, il inclut C1 et Shinkanjo, mais contrairement à TXR3, Import Tuner Challenge ne propose pas les autoroutes de Nagoya, Osaka et Yokohama. En revanche, le jeu inclut deux nouvelles sections d'autoroutes de Tokyo, à savoir la Route 3 Shibuya et la Route 4 Shinjuku.
Après que les 13 Diables aient été vaincus une fois de plus dans le circuit Kaido, Motoya Iwasaki, alias Speed King, disparaît soudainement, sans laisser de trace. Depuis, de nombreux pilotes venus de toute la Japan se rendent à Tokyo dans le but de lui reprendre son titre de « Speed King ». Le héros ici est le meilleur ami d'Iwasaki et bat Bloodhound, Midnight Cinderella, Platinium Prince, la bande de Skull Bullet, et finalement le Phantom 9. En parallèle, Bloodhound révèle au pilote pourquoi Iwasaki a été déprimé pendant longtemps : sa petite amie est morte à cause d'une maladie et Iwasaki n'était pas là pour la soutenir.

