
Teenage Mutant Ninja Turtles : Sewer Run est un jeu d'action basé sur le navigateur. Les événements se déroulent directement après Teenage Mutant Ninja Turtles : Dark Horizons. Le jeu se compose de quatre niveaux, chacun comportant une section course et une section combat. La section course consiste à faire courir la Tortue sélectionnée pour rattraper sa cible avant que le temps ne s'épuise, tandis que la section combat consiste à faire battre la Tortue un certain nombre de soldats du Clan des Pieds en ripostant aux shurikens lancés vers elle.
Chaque Tortue possède son propre mouvement spécial (Leonardo peut utiliser son katana pour casser des rochers, Donatello peut utiliser sa massue pour faire un double-saut, Michelangelo peut utiliser son kusarigama comme grappin pour se balancer, et Raphael peut utiliser ses sais pour grimper aux murs). Chaque Tortue ne peut être utilisée qu'une seule fois, ce qui signifie que chacun des quatre niveaux doit être réussi par une Tortue différente.
