
Teenage Mutant Ninja Turtles: Sewer Run è un gioco d'azione basato sul browser. Gli eventi si svolgono direttamente dopo Teenage Mutant Ninja Turtles: Dark Horizons. Il gioco è composto da quattro livelli, ciascuno dei quali presenta una sezione di gara e una sezione di combattimento. Nella sezione di gara, la tartaruga selezionata deve raggiungere il bersaglio prima che il tempo scada, mentre nella sezione di combattimento la tartaruga deve sconfiggere un numero selezionato di soldati Foot colpendo indietro i shuriken lanciati verso di lui.
Ogni Tartaruga ha il proprio movimento speciale (Leonardo può usare le sue katana per rompere le rocce, Donatello può usare il suo bastone per fare un doppio salto, Michelangelo può usare il suo kusarigama come moschettone per dondolarsi intorno, e Raffaello può usare i suoi sai per arrampicarsi sui muri). Ogni Tartaruga può essere utilizzata in un solo livello, il che significa che ciascuno dei quattro livelli deve essere completato da una diversa Tartaruga.
