Descrizione
A differenza della sua controparte per SNES, la versione per Genesis di Scooby-Doo Mystery è un'avventura point-and-click (o meglio, point-and-press button) che presenta due episodi giocabili tipici di un cartone animato Scooby-Doo.
Blake's Hotel - Lo zio Blake di Daphne ha invitato la banda a trascorrere un fine settimana sugli sci al suo hotel. Giunti all'hotel, scoprono che lo spirito dell'Antico Capitano sta spaventando tutti i clienti, poiché non è felice che un hotel sia stato costruito sulle sue terre di sepoltura. Presto lo zio Blake viene rapito e tocca a Scooby e Shaggy raccogliere indizi e cacciare questo fantasma.
Ha Ha Carnival - La banda arriva a un carnovale quasi deserto, alla ricerca di un po' di divertimento. Presto Fred, Daphne e Velma vengono intrappolati in una vasca quando escono su uno dei mezzi di trasporto. Non solo, qualcuno ha danneggiato le rotaie della montagnarusa. Poi un clown fantasma con aspetto sinistro fa in modo che Scooby e Shaggy vengano inseguiti per tutto il carnovale. Un'altra misteriosa avventura da risolvere per la coppia.
Entrambi i misteri vedono Scooby e Shaggy agire da soli, raccogliendo indizi e mettendoli insieme. Si controlla principalmente Shaggy, mentre Scooby lo accompagna. L'interfaccia del gioco prevede di muoversi intorno e/o di scegliere azioni da un menu e utilizzarle sugli oggetti. È presente una funzione di password per poter riprendere da dove si era lasciato.