
Nella versione per 3DS di Sonic Generations, la meccanica di gioco di Modern Sonic è simile a quella di Sonic Rush e alla versione per DS di Sonic Colors. Ha a disposizione il Boost, la capacità di scivolare sotto gli ostacoli, saltare da pareti e l'Homing Attack. Dopo la seconda era, Modern Sonic impara lo Stomp. I livelli di Modern Sonic utilizzano più attivamente l'effetto 3D della profondità nella versione per 3DS, oltre a fornire una migliore visuale quando Modern Sonic salta in background, anche se le versioni console sono compatibili con la TV 3D. Nella versione HD, Modern Sonic può saltare solo da pannelli specifici (simile alla versione DS di Sonic Colors), ma nella versione per 3DS può saltare da qualsiasi parete (proprio come in Sonic Unleashed e nella versione per Wii di Sonic Colors).
La storia inizia con Classic Sonic a Green Hill. Dopo aver completato l'Act 1, appare un vortice viola nel cielo e sorprende Classic Sonic. Dopo di che, si arriva direttamente ai giorni nostri e Sonic viene invitato a una festa di compleanno da Tails. Tuttavia, Sonic arriva in anticipo, quindi Tails gli dice di aspettare. Ma poi un vortice risucchia Tails dentro. Sonic salta dentro ma viene "attaccato", pur riuscendo comunque ad entrare. Sonic vede un mondo bianco e si chiede cosa stia succedendo. Modern Sonic salva Tails dopo aver ripristinato Green Hill, e Tails gli dice che vede una grande città in notturna e un gigantesco fungo, quindi Sonic decide di andare a controllare quei posti, seguito da Classic Sonic, che Tails crede essere Modern Sonic.
| 3DS | 24 novembre 2011 |


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