
Die SNES-Version des Spiels verfügt über dieselbe Form des VS-Modus und des Action-Modus wie ihr Vorgänger. Es gibt jedoch einige bemerkenswerte Unterschiede zwischen der alten und der neuen Version. Erstens sind die Grafiken stark verbessert und stecken voller reicher Farben, wodurch das Spiel optisch viel ansprechender ist als die früheren Versionen. Ein weiterer wichtiger Unterschied ist das Design von Yoshi, das sich von seiner NES-Version zu einer Form entwickelt hat, die der aus Yoshi's Island ähnlicher ist. Die SNES-Version enthält einen zusätzlichen Puzzle-Modus, in dem die Spieler das Spielbrett in einer begrenzten Anzahl von Zügen befreien müssen. In diesem Modus gibt es 100 einzigartige Puzzles.



