
A versão SNES do jogo possui a mesma forma do modo VS e modo Action que seu antecessor. No entanto, existem algumas diferenças notáveis entre as versões antigas e novas. Primeiro, os gráficos são muito melhorados, com cores ricas que tornam o jogo muito mais agradável visualmente do que as versões anteriores. O design do Yoshi é outra diferença importante, evoluindo de sua versão NES para uma mais semelhante à vista em Yoshi's Island. A versão SNES tem um modo adicional de quebra-cabeça, onde os jogadores devem limpar o tabuleiro do jogo em um número limitado de movimentos. Existem 100 quebra-cabeças únicos nesse modo.



