
Capcom vs. SNK 2 EO es el mismo juego pero con cambios menores en la jugabilidad y la inclusión de un sistema EO ("Easy Operation") que permite al jugador realizar ataques específicos simplemente moviendo el joystick analógico derecho en una dirección determinada. Al igual que todas las otras versiones caseras del juego, CvS2: EO también contiene cuatro personajes bonus: Evil Ryu, Orochi Iori, Shin Akuma (Shin Gouki en Japón) y Ultimate Rugal (God Rugal en Japón), versiones potenciadas de cuatro personajes normales. Antes de seleccionar un equipo, el juego ofrece una selección de "Grooves", los cuales cambian la forma de jugar, así como los "AC-ism" o "GC-ism" Grooves; GC-ism simplifica el esquema de control, originalmente diseñado para el mando de GameCube. En la versión de Xbox se llama EO-ism. Capcom vs. SNK 2 EO también eliminó el fallo de Roll Cancel que estaba presente en las versiones originales. Además, la versión de Xbox de CvS2: EO también incluyó juego en línea para hasta dos jugadores en Xbox Live, así como soporte para progresive-scan (480p), algo que claramente faltaba en la versión para PlayStation 2.
| NGC | 14 de julio de 2003 |
| XBOX | 16 de julio de 2003 |