
Los dos juegos de Game Boy Advance basados en la serie animada de TMNT de 2003 fueron reeditados posteriormente en la misma cartucho.
TMNT 2003: La jugabilidad principal adapta de manera suelta los siguientes episodios de la primera temporada: "Things Change", "A Better Mouse Trap", "Attack of the Mousers", "Meet Casey Jones", "Nano", "Darkness on the Edge of Town", "The Way of Invisibility", "Notes From the Underground" (Partes 1-3), y "Return to New York" (Partes 1-3), así como un nivel que no se deriva en absoluto de la serie animada. Poco después de que un grupo de robots mouser destruya la antigua casa de las tortugas, estas comienzan a buscar una nueva. Michelangelo termina molestando a Raphael, lo que hace que este último se vaya a la superficie. En la superficie, Raphael es confrontado por matones de los Purple Dragon, Casey Jones y Dragonface. Pronto, Baxter Stockman usa ninjas de la tecnología invisible del pie para capturar a Raphael, y Donatello se ve obligado a rescatarlo. Después, mientras Raphael y Michelangelo se entrenan por diversión, Donatello analiza un cristal extraño que encontró en su hogar, notando que se parece a células cerebrales mutadas. Raphael patea a Michelangelo contra una pared, revelando un gran túnel detrás de ella. El cristal de Donatello comienza a brillar y las tortugas deciden investigar. Sigue el túnel y son confrontados por humanos mutados genéticamente. Después de algunos enfrentamientos con estos mutantes, las tortugas descubren que estos fueron transformados en su estado actual por experimentos pasados de los científicos de Shredder. Los cristales que encontró Donatello son lo único que mantiene con vida a estos mutantes, y no pueden salir de su hogar subterráneo como resultado. Les piden a las tortugas que derroten a Shredder, para que ningún humano sufra como ellos. Las tortugas deciden derrotar a Shredder una vez por todas y prometen a los mutantes que regresarán por ellos si alguna vez encuentran una manera de revertir su condición. TMNT 2: Battle Nexus: El juego comienza con una batalla contra el Clan del Pie y Hun en el rascacielos de Oroku Saki. El Clan del Pie es derrotado, y el Maestro Splinter desaparece misteriosamente. Las Tortugas siguen la pista hasta un edificio marcado "T.C.R.I.", que resulta ocultar un secreto extraño bajo su apariencia inofensiva: sus empleados son miembros de una raza alienígena similar al cerebro, los Utroms. Mientras luchan contra estos nuevos enemigos extraños, las Tortugas son accidentalmente teleportadas a diferentes puntos del universo, donde conocen al profesor Fugitoid Honeycutt en D'Hoonib, y terminan en medio del conflicto entre los Triceratons y la Federación - ambos bandos buscan al Fugitoid por su tecnología. A lo largo del camino, se encuentran con un cazador de recompensas intergaláctico llamado Slashuur. Se dice que es el cazador de recompensas más poderoso del universo, y Honeycutt escuchó leyendas sobre él desde que era niño. Irónicamente, es Honeycutt quien Slashuur persigue, habiendo sido contratado por los Triceratons para capturarlo. Después de que las Tortugas lo derroten, Slashuur revela que tiene conocimiento sobre Hamato Yoshi antes de despedirse. Antes de escapar del mundo natal de los Triceratons, las Tortugas se hacen amigos y liberan a un noble guerrero Triceraton que había sido forzado a luchar como gladiador, Traximus. Al regresar a la Tierra y al edificio T.C.R.I., se revela que los Utroms habían rescatado a Splinter herido y lo estaban cuidando. Los Utroms colocan a las Tortugas y a Splinter en una máquina de realidad virtual para explicarles mejor sus orígenes. Hace cientos de años, los Utroms viajaban por la galaxia, transportando a un asesino de su especie, Ch'rell. Su nave aterriza en la Tierra en el país de Japón. Ch'rell escapa, mientras que los Utroms deben esperar a que la tecnología terrestre alcance la suya para poder regresar a casa. Un tiempo después, después de que los Utroms hayan reclutado la ayuda de algunos humanos como Guardianes Ninja, los Utroms son atacados por un poderoso guerrero armado conocido como El Shredder. Mientras tanto, en el mundo real, Baxter Stockman sabotea la máquina de realidad virtual, y los peligros dentro de ella se presentan como reales para las Tortugas y Splinter. Después de derrotar a Shredder y a sus Ninjas del Pie Feudales, las Tortugas se reúnen con el Utrom Mortu, quien les da un dispositivo que les permite regresar al mundo real. Desafortunadamente, cuando llegan allí, descubren que Shredder y el Clan del Pie están atacando el edificio T.C.R.I. Durante su lucha, se planta un dispositivo de destrucción orgánica, y los Utroms escapan a través de su Transmat. Las Tortugas derrotan a Shredder antes de que pueda perseguirlos, y se revela que no solo este Shredder es el mismo que vieron en Japón Feudal, sino que también es el malvado Utrom Ch'rell. Las Tortugas escapan del edificio antes de que el dispositivo se active, pero Ch'rell no tiene tanta suerte.
| GBA | 17 de marzo de 2006 |


