
Os dois jogos Game Boy Advance baseados na série de desenho animado TMNT de 2003 foram posteriormente reeditados no mesmo cartucho.
TMNT 2003: A jogabilidade principal adapta de forma solta os seguintes episódios da primeira temporada: "Things Change", "A Better Mouse Trap", "Attack of the Mousers", "Meet Casey Jones", "Nano", "Darkness on the Edge of Town", "The Way of Invisibility", "Notes From the Underground" (Partes 1-3) e "Return to New York" (Partes 1-3), bem como um nível que não se baseia em absoluto na série animada. Logo após um grupo de robôs mouser destruir a antiga casa das tartarugas, elas começam a procurar uma nova casa. Michelangelo acaba incomodando Raphael, fazendo com que ele saia para a superfície. Na superfície, ele é confrontado por bandidos do Purple Dragon, Casey Jones e Dragonface. Baxter Stockman logo usa ninjas da tecnologia invisível do pé para capturar Raphael, e Donatelo é forçado a resgatá-lo. Depois disso, enquanto Raphael e Michelangelo lutam por diversão, Donatelo analisa um cristal estranho que encontrou em sua casa, notando que eles parecem células cerebrais mutantes. Raphael chuta Michelangelo para uma parede, revelando um túnel grande atrás dela. O cristal de Donatelo começa a brilhar e as tartarugas decidem investigar. Elas seguem o túnel e são confrontadas por humanos geneticamente mutantes. Após alguns confrontos com esses mutantes, as tartarugas descobrem que esses mutantes foram transformados em seu estado atual por experimentos anteriores dos cientistas de Shredder. Os cristais encontrados por Donatelo são a única coisa mantendo esses mutantes vivos, e eles não podem sair de sua casa subterrânea por isso. Eles imploram às tartarugas que derrotem Shredder, para que mais humanos não sofram como eles. As tartarugas decidem derrotar Shredder uma vez por todas e prometem aos mutantes que voltarão para eles se algum dia encontrarem uma maneira de reverter sua condição. TMNT 2: Battle Nexus: O jogo começa com uma batalha contra o Clã do Pé e Hun no arranha-céu de Oroku Saki. O Pé é derrotado e Master Splinter desaparece misteriosamente. As Tartarugas perseguem a pista até um prédio marcado com "T.C.R.I.", que revela-se esconder um segredo bizarro por trás de sua fachada inofensiva: seus funcionários são membros de uma raça alienígena semelhante a cérebros, os Utroms. Enquanto lutam contra esses novos inimigos estranhos, as Tartarugas são acidentalmente teleportadas para diferentes pontos da galáxia, encontrando o Professor Honeycutt, o Fugitoid, em D'Hoonib, e acaba-se envolvidas na guerra entre os Triceratons e a Federação - ambos os lados estão atrás do Fugitoid por causa de sua tecnologia. Ao longo do caminho, elas encontram um caçador de recompensas interestelar chamado Slashuur. Dizem que é o caçador de recompensas mais poderoso do universo, e Honeycutt ouviu lendas sobre ele quando era criança. Irônicamente, é Honeycutt que Slashuur está atrás, tendo sido contratado pelos Triceratons para capturá-lo. Após as Tartarugas vencê-lo, Slashuur revela que tem conhecimento sobre Hamato Yoshi antes de partir. Antes de escapar do mundo natal dos Triceratons, as Tartarugas se tornam amigas e libertam um guerreiro Triceraton nobre que havia sido forçado a lutar como gladiador, Traximus. Ao retornar à Terra e ao prédio da T.C.R.I., revela-se que os Utroms haviam resgatado um Splinter ferido e estavam cuidando dele. Os Utroms colocam as Tartarugas e Splinter em uma máquina de realidade virtual para melhor explicar suas origens. Há centenas de anos, os Utroms estavam viajando pela galáxia, transportando um criminoso solitário de sua espécie, Ch'rell. Seu navio colide na Terra no país do Japão. Ch'rell escapa, enquanto os Utroms são forçados a esperar pela tecnologia terrestre alcançar a deles, para que possam voltar para casa. Algum tempo depois, após os Utroms terem recrutado a ajuda de alguns humanos como Ninja Guardianes, os Utroms são surpreendidos por um guerreiro fortemente armado conhecido como o Shredder. Enquanto isso, no mundo real, Baxter Stockman sabotega a máquina de realidade virtual, e os perigos dentro dela tornam-se reais para as Tartarugas e Splinter. Após derrotar Shredder e seus Ninja do Pé Feudal, as Tartarugas encontram o Utrom Mortu, que lhes dá um dispositivo que permite que retornem ao mundo real. Infelizmente, quando chegam lá, descobrem Shredder e o Pé atacando o prédio da T.C.R.I. Durante sua luta, um dispositivo de destruição orgânica é plantado, e os Utroms escapam por meio de seu Transmat. As Tartarugas derrotam Shredder antes que ele possa persegui-los, e revela-se que não apenas este Shredder é o mesmo que elas viram no Japão Feudal, mas também é o malvado Utrom Ch'rell! As Tartarugas escapam do prédio antes que o dispositivo seja acionado, mas Ch'rell não tem tanta sorte.
| GBA | 17 de março de 2006 |


