
Shin Megami Tensei: Synchronicity Prologue ist ein Bonusgame, das zur Vermarktung von Shin Megami Tensei: Deep Strange Journey (auch Strange Journey Redux genannt) veröffentlicht wurde. Dieses 2D-Action-Adventure mit Erkundungs- und Plattformelements spielt mit Jack Frost, einer Figur, die Fans von Shin Megami Tensei und Atlus-Spielen bekannt sein dürfte.
Die Handlung spielt kurz vor den Ereignissen von Shin Megami Tensei: Strange Journey. Jack Frost ist mit dem Geist eines Menschen synchronisiert, um die Schwarzwelt zu durchqueren und sich gegen Dämonenscharen zu verteidigen. Er rettet Jack o' Lantern, der nicht synchronisiert ist, nachdem dieser von Black Frost eingefroren wurde, der alle bisherigen Angriffe der Jacks vernichtet hat. Auf ihrer Reise begegnen sie einem kleinen Wesen, das sich selbst J-kun nennt. Die Jacks durchqueren die verschiedenen Sektoren der Schwarzwelt, um Black Frost zu besiegen, und kämpfen dabei gegen Bifrons, Decarabia, Alice und Girimehkala. Nachdem sie diese besiegt haben, begegnen sie erneut J-kun, der ihnen mitteilt, dass er sich an seine menschliche Vergangenheit erinnert, bis er ein Synchronisierungsprogramm startete, das an ihn gesendet wurde, wodurch sein Geist in den Körper eines Dämons in der Schwarzwelt gelangte. Sie erkennen, dass das Zerstören von Black Frost die einzige Möglichkeit ist, J-kun zurückzubringen. Nachdem sie Black Frost besiegt haben, erscheint J-kun und enthüllt, dass Black Frost der fehlende Teil seines Geistes ist. Er bittet die Jacks, Black Frost zu zerstören, um ihn zu befreien und hoffentlich in seinen menschlichen Körper zurückkehren zu können. Die Frosts tun dies und befreien J-kun. Die Credits zeigen eine Liste weltweiter Nachrichten, darunter den Tod/ die Genesung eines berühmten Programmers (je nach Ende), eine geheimnisvolle Schneesturm in der Antarktis und die Gründung des Schwarzwelt Joint Projects.