
Shin Megami Tensei: Synchronicity Prologueは、Shin Megami Tensei: Deep Strange Journey(通称Strange Journey Redux)の宣伝を目的としてリリースされたボーナスゲームです。この探索・プラットフォーミングアクションの2Dゲームには、Shin Megami Tenseiおよびアトラスのゲームシリーズのファンに親しまれているキャラクターであるジャック・フロストが登場します。
シャイニング・メガミ・テンセイ:ストレンジ・ジャーニーの出来事の直前に舞台を置く本作では、ジャック・フロストは人間の心と同期することで、悪魔の大群を乗り越えて戦う。ブラック・フロストによって凍結されてしまったノン・シンクロのジャック・オ・ランタンを救い出す。ブラック・フロストは以前のジャックスの攻撃をすべて壊滅させた存在である。その後、彼らは自分を「J-kun」と名乗る小さな存在と出会う。 ジャックスたちは、ブラック・フロストを倒すためにシュヴァルツヴェルトのさまざまなセクターを旅し、ビフロンス、デカラビア、アリス、ギリメカーラらと戦う。ギリメカーラを倒した後、彼らは再びJ-kunと合流し、彼は自分がかつて人間であったことを思い出したと告げる。しかし、彼が同期プログラムを起動して、シュヴァルツヴェルトの悪魔の体に自分の心を移してしまったため、今の状態になった。ジャックスたちは、J-kunを元の姿に戻すにはブラック・フロストを倒すしかないことを理解する。 ブラック・フロストを倒した後、J-kunが登場し、ブラック・フロストが彼自身の心の欠片であることを明かす。そして、ジャックスたちにブラック・フロストを破壊して自分を解放するよう懇願する。そうすれば、彼は人間の体に戻れるかもしれないと。フロストたちはその願いを叶え、J-kunを解放する。 エンディングのクレジットでは、世界のニュースがリスト形式で紹介される。その中には、有名プログラマーの死または回復(エンディングによって異なる)、南極で謎の雪嵐が発生したニュース、そしてシュヴァルツヴェルト共同プロジェクトの設立が含まれている。