
Shin Megami Tensei: Synchronicity Prologue é um jogo bônus lançado para promover Shin Megami Tensei: Deep Strange Journey (também conhecido como Strange Journey Redux). Este jogo de ação 2D de exploração e plataformas apresenta Jack Frost, um personagem familiar aos fãs de Shin Megami Tensei e dos jogos da Atlus.
Acontecendo pouco antes dos eventos de Shin Megami Tensei: Strange Journey, Jack Frost é sincronizado com a mente de um humano para atravessar e combater multidões de demônios. Ele resgata o Jack o' Lantern não sincronizado, que foi congelado por Black Frost, que dizimou todos os Jacks que anteriormente haviam tentado um ataque. Eles encontram uma pequena criatura que se chama J-kun. Os Jacks atravessam os diferentes Setores da Schwarzwelt para derrotar Black Frost, lutando contra Bifrons, Decarabia, Alice e Girimehkala no caminho. Após derrotar o último, os Jacks se reencontram com J-kun, que lhe diz que se lembrou de ter sido humano, até que ele ativou um programa de sincronização enviado a ele, enviando sua mente para o corpo de um demônio na Schwarzwelt. Eles percebem que destruir Black Frost é a única maneira de devolver J-kun. Após derrotar Black Frost, J-kun aparece, revelando que Black Frost é a parte faltante de sua mente, e pede aos Jacks que destruam Black Frost para libertá-lo, esperando assim retornar ao seu corpo humano. Os Frosts fazem isso, libertando J-kun. Os créditos mostram uma lista de notícias mundiais, incluindo a morte/recuperação de um programador famoso (dependendo do final), uma nevasca misteriosa na Antártida e a formação do Projeto Conjunto Schwarzwelt.