

The Plutonia Experiment est l'un des deux IWADs officiels de 32 niveaux de Doom II qui composent Final Doom. Il a été créé par les frères Dario et Milo Casali sous contrat avec id Software, et a été publié en même temps que son homologue TNT: Evilution le 17 juin 1996.
Dans The Plutonia Experiment, après l'invasion catastrophique de l'Enfer sur Terre, les gouvernements mondiaux décident de prendre des mesures contre toute invasion future possible, sachant que les forces de l'Enfer restaient encore puissantes. La UAC est refondue sous une toute nouvelle direction (les anciens administrateurs et actionnaires étant d'ailleurs tous morts de toute façon) et vise à développer des outils capables d'empêcher les invasions démoniaques. Les scientifiques commencent à travailler sur un dispositif appelé l'Accélérateur Quantique, conçu pour fermer les Portes d'invasion et arrêter toute invasion potentielle. Les expériences ont lieu dans un complexe de recherche secret, avec une unité stationnaire de marins. Le travail semble bien avancer, mais les créatures venues d'Outre attirent l'attention sur la nouvelle recherche. Une Porte s'ouvre au cœur du complexe et des horreurs incommensurables s'échappent. L'Accélérateur Quantique fonctionne à merveille : la Porte est rapidement refermée et l'invasion est arrêtée. Les recherches reprennent avec plus d'audace. Le lendemain, un cercle de 7 Portes s'ouvre et une invasion encore plus grande commence. Pendant une heure, les Accélérateurs Quantiques parviennent à fermer 6 des Portes, mais l'armée infernale est devenue trop nombreuse et trop puissante. Le complexe est envahi. Tout le monde est tué, ou transformé en zombie. La dernière Porte de l'Enfer reste ouverte, gardée par un Gardien de la Porte : un démon puissant, énorme et ancien, capable d'ouvrir des Portes dimensionnelles et de les contrôler ou de les protéger. Le gouvernement, paniqué à l'idée que l'Accélérateur Quantique soit détruit ou utilisé contre l'humanité, ordonne à tous les marins de se rendre immédiatement sur les lieux. Le joueur, le marin spatial anonyme, était en congé à la plage. Il était aussi le plus proche du site et arrive le premier. Il découvre que l'activité démoniaque (hurlements, chants, bruits de machines) est intense à l'intérieur du complexe ; le Gardien de la Porte est clairement en train de travailler à quelque chose, et son œuvre atteindra bientôt un affreux paroxysme. Il comprend également que, lors de l'arrivée des marins, ceux-ci ne pourraient pas pénétrer le complexe fortement infesté, malgré le feu nourri et le soutien dont ils disposeraient. Le marin décide d'entrer seul dans le complexe pour arrêter le Gardien.