

La tua missione, come comandante di X-COM, è combattere l'aggressione aliena e svelare le loro intenzioni mortali. Ma attento! L'infiltrazione aliena nella città e nella sua politica potrebbe vederti sotto fuoco da bande criminali, sette religiose e persino dalla polizia! Le flotte aliene riempiono i cieli, creature terrorizzano la città, il caos regna... Benvenuto nella guerra, benvenuto all'Apocalisse.
Mezzo secolo dopo la fine della seconda campagna di X-COM, l'ultimo scontro a T'leth ha gravemente danneggiato la biosfera terrestre. Di conseguenza, sono state proposte diverse città autosufficienti del tipo Megalopolis per fornire un'abitazione all'umanità. Il gioco segue Mega-Primus, la prima di queste città, costruita sulle rovine di Toronto, in Canada. Intanto, la colonia marziana extra-terrestre viene sfruttata dalla corporazione mineraria di Elerium, Solmine, e oppressa da MarSec (MARs SECurity). La minaccia aliena nel gioco è rappresentata da una nuova razza di alieni organici, extradimensionali, che inizialmente sembrano non avere alcun rapporto con gli alieni dei due giochi precedenti, anche se missioni successive ambientate nella loro dimensione d'origine rivelano che hanno schiavizzato i superstiti dei Sectoid. Questi nuovi alieni attaccano la città attraverso porte di teletrasporto a forma di tetraedro. Il giocatore deve scoprire come inviare i propri aerei, insieme agli agenti di X-COM, attraverso queste porte senza essere distrutto e portare la guerra agli alieni. Apocalypse ha 14 razze di esseri alieni, tra cui Anthropods, Brainsuckers, Hyperworms, Megaspawns e Micronoids. Ogni razza ha diverse forze e debolezze, e alcune razze dipendono da altre. Il "ciclo vitale alieno" gioca un ruolo cruciale nel gioco. Il giocatore viene esposto a questo "ciclo vitale alieno" attraverso la ricerca e, soprattutto, gli attacchi di basso livello degli alieni durante le battaglie di raccolta dei campioni. In primo piano c'è l'attacco dell'alieno armato, il Brain-Sucker, che attacca singoli individui dopo l'atterraggio da un lanciatore utilizzato dai soldati alieni. Il Brain-Sucker si schiude e attacca l'individuo più vicino saltandogli in testa e iniettandogli qualcosa attraverso la bocca, morendo immediatamente dopo l'attacco. Il ciclo vitale prende poi una piega misteriosa, mostrando nessun collegamento tra le forme inferiori e quelle superiori degli alieni. Alla fine, però, si scopre che i leader dell'invasione sono i Micronoids, una razza di organismi unicellulari intelligenti che vivono nei flussi sanguigni degli altri alieni; l'obiettivo finale dell'invasione è iniettare i Micronoids nei flussi sanguigni di figure importanti, permettendo loro di controllare Mega-Primus attraverso la dominazione psionica dei loro ospiti. Il giocatore viene infine incaricato di invadere il pianeta d'origine degli alieni e distruggere il loro lato della porta, l'unico modo per fermare l'infestazione dei Micronoids.
| PC | 30 giugno 1997 |
| DOS | 30 giugno 1997 |

| Audio | Sottotitoli | Interfaccia | |
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